學術科研工作是偽滿皇宮博物院立院之本。建院以來，我院科研人員立足院藏文物資源特色，結合文物研究、陳列展覽、遺址修繕等工作協同研究需要，圍繞溥儀及其時代歷史、偽滿洲國史、抗日戰爭史、東北亞區域歷史以及現代博物館發展理念、陳列展覽研究、文創產業等專業研究領域，累計發表學術論文數百篇、學術專著百餘部，承擔多項國家級社科基金項目。近年來，我院明確提出“學術立院”工作方針，進一步加大學術科研投入力度，依託溥儀研究院、長春文博講壇、長春溥儀研究會以及《溥儀及其時代》雜誌等院內學術科研工作平臺，利用高校、科研院所、博物館、檔案館、出版社等院外協同研究力量，穩步扎實推進我院學術科研建設規劃。力爭未來將我院建設成為溥儀生平、偽滿宮廷史、東北淪陷史、日本侵華史的學術研究中心和文物資料收藏、交流、展示中心。