自2002年开始，本着“抢救为主、保护第一”原则，以规划设计为科学依据，先后精心组织实施了同德殿、怀远楼、东御花园、御用防空洞、天照大神防空洞、建国神庙遗址、游泳池等一期复原工程。一期复原工程竣工后，又先后组织实施了二、三期复原工程，包括近卫军营区、西御花园、植秀轩、畅春轩、宫内府、日本宪兵室、围墙、碉堡、马厩、御用花窖及缉熙楼、勤民楼的加固维修，基本完成了伪满皇宫主体部分原貌恢复工作，圆满完成了“三年恢复伪满皇宫原貌”的工作目标。

　　伪满皇宫旧址基本恢复原貌后，展区由原来的1．2万平方米增加到4．6万平方米，参观时间由原来的1小时延长至4小时，展览内容较原来增加2倍，游客流量尤其是海外游客明显增多，社会反响非常好，经济效益大幅增长。一期复原工程竣工后，时任吉林省省委书记王云坤专程到伪满皇宫视察，对恢复保护工作给予了充分肯定。省长洪虎等省领导和省直有关部门负责同志多次到伪满皇宫检查指导工作。洪虎省长强调指出：实践证明，当年省委、省政府将伪满皇宫旧址划归长春市进行属地管理的决定是正确的；伪满皇宫恢复保护工作之所以在短期内取得如此成绩，是省、市政府及相关部门合力攻坚的结果；伪满皇宫恢复保护工作创造性地走出了一条保护和开发相结合的新路子，值得认真总结。在此期间，李岚清、尉健行、钱其琛等国家领导人和国家有关部门的领导也曾先后多次到伪满皇宫视察，并对复原工程给予了充分肯定。海内外媒体、国内同行和社会公众也都给予了高度评价。

　　伪满皇宫旧址保护恢复的另一项重点工作是周边环境治理。由于历史的原因，伪满皇宫旧址内90%以上的面积被11家单位和600多户居民占用，搬迁安置难度相当复杂繁难。在省、市政府的高度重视和有关部门的大力配合下，通过动用行政手段、舆论监督、市场运作和细致的思想工作等方式，使得伪满皇宫旧址周边环境治理工作取得了突破性进展。在市建委等多家单位的共同努力下，先后投入资金1.2亿元，拆迁1100多户，使陕西路拓宽至32米，打通了通往伪满皇宫的交通要道。在市石油公司的支持下，拆迁了堵在伪满皇宫正门前的大庆加油站。在省文化厅的大力支持下，省博物院、省文物店和省自然博物馆也陆续完成搬迁，迁出了占据伪满皇宫正门右侧近40年的马家食杂店和近卫军营房区域97户居民。此外还先后完成了鞋城、宽城区前进印染厂、南关区物资供应站、七十中学、交通运输市场、蔬菜批发市场、回民小学和525户居民的搬迁工作。修建了光复广场和南停车场，完成了道路建设和园林绿化，彻底解决了原来周边环境脏乱、可进入性差等问题。